Counter Origen de la vida

PROGRAMA

(Requisitos: Lehninger hasta el capítulo 11 ó Mathews hasta el capítulo 10)

 

Lógica molecular de la vida

L1-M1

del universo: somos polvo de estrellas

figura : comparación relativa elemental

                        figura : constituyentes de 1º, 2º , 3º línea y ocasionales

vídeo : potencias de diez

 

Introducción al metabolismo

L14-M12

            concepto básico y diseño: catabolismo, anabolismo

autótrofos, heterótrofos

            reacciones favorables termodinámicamente

propiedades especiales del ATP: recambio de ATP

            compuestos fosfato de alta energía: PEP, PCreatina, Carbomoil P, PP

            figura : autopistas metabólicas

vida en un ambiente oxidante

reacciones de óxido - reducción

cociente respiratorio

anaeróbico: fermentación

acarreadores de electrones: NADH, NADPH, FADH2, FMNH2

equivalente reductor

figura : catabolismo - biosíntesis

acarreadores en el metabolismo

figura : CoA, Lipoamida, THF, SAM, Biotina, TPP, UDP, CDP, NuTP

                        vitaminas hidrosolubles: coenzimas

                        vitaminas liposolubles: hemostasia, metab. de Ca y P, visión, fertilidad

estadios en la extracción de energía de los alimentos

las mayores vías metabólicas

            separación entre biosíntesis y degradación

            mayores mecanismos de control metabólico

                        nivel de enzimas

                        actividad enzimática: covalente y alostérico

                        compartimentalización

                        regulación hormonal

            ribonucleótidos: moléculas centrales a todas las formas de vida

                        RNA antecede al DNA evolutivamente

 

Metabolismo de...

 

Hidratos de carbono

digestión y absorción

            tipos y cantidad

            requerimientos: valor calórico

            papel del intestino grueso

            enzimas digestivas

            transportadores

            figura  : cotransporte de Na+ y glucosa

            mal absorción e intolerancia

            efecto del tamaño molecular

índice glicémico

fibra dietética: definición

            tipos y composición

            razón del interés

            propiedades físicas

            respuestas fisiológicas a fuentes de fibra dietética

            recomendaciones

destino de los azúcares

                        mantener glicemia

            reserva de glucógeno

                        exceso: almacén lipídico

            oxidación completa

                        vía de las pentosas

 

Glucólisis

L15-M13

            aerobia y anaerobia: fermentaciones

historia

            fase de inversión de energía

                        hexocinasa y glucocinasa : ATP y Mg+2

                        fosfoglucoisomerasa

                        fosfofructocinasa

                        aldolasa

                        fosfotriosaisomerasa

            fase de generación de energía

                        gliceraldehído 3P deshidrogenasa: NAD+ y Pi

fosfoglicérico cinasa: fosforilación al nivel de sustrato

eritrocito: formación del 2,3 BPG

                        fosfoglicérico mutasa

                        enolasa

                        pirúvico cinasa: K+

destino del piruvato: lactato, etanol, alanina, acetilCoA

efecto Pasteur

            regulación: fosfofructocinasa, pirúvico cinasa

            figura  : regulación de glucólisis

            glucólisis tanto catabólica como anabólica

                        figura  : conexiones glucolíticas

            alteraciones: def. de hexocinasa, def. de pirúvico cinasa, acidosis láctica

            entrada de otros azúcares a glucólisis

                        galactosa: UDP, galactosemia

                        fructosa, manosa

                        glicerol

 

Ciclo del ácido cítrico

L16-M14

            estadios de la respiración

            formación de acetil CoA de piruvato: complejo de pirúvico deshidrogenasa

                        coenzimas de flavina: FAD y FMN

TPP: beriberi es una deficiencia de tiamina (B1)

lipoamida

CoA y NAD+

                        figura  : operación del complejo

            introducción de dos átomos de carbono como acetil CoA

            isomerización de citrato

            generación de CO2 por una deshidrogenasa NAD+ dependiente

            generación de un segundo CO2 por un complejo multienzimático

            fosforilación al nivel de sustrato

            deshidrogenación dependiente de flavina

            hidratación de un doble enlace carbono-carbono

            deshidrogenación que genera el sustrato para el próximo ciclo

            estequiometría y energética del ciclo de Krebs

            regulación de

pirúvico deshidrogenasa

el ciclo de Krebs

figura  : factores reguladores del ciclo

            reacciones anapleróticas

                        figura  : papel biosintético de intermediarios del ciclo

 

 

Primer parcial

 

 

Fosforilación oxidativa

L19-M15

            mitocondrias: estructura y compartimentación

                        composición de membrana interna, externa, matriz y esp. intermembrana

            transferencia de electrones: reacciones de óxido-reducción

            sistema de transporte electrónico mitocondrial

                        figura : cadena de transporte electrónico

inhibidores y aceptores artificiales de electrones: cianuro, CO, otros

            la fosforilación oxidativa está acoplada al transporte electrónico

            hipótesis: acoplamiento químico, fosforilación de sustrato, conformacional

            mecanismo de acoplamiento quimiosmótico: gradiente y bomba de protones

                        figura : complejos respiratorios y ATPasa

                        desacopladores

            transporte o lanzadera de equivalentes reductores

                        lanzadera de aspartato-malato y de glicerol-fosfato

                        figura : lanzaderas

                        los acetilos son transportados como citrato

                        translocasas de nucleótidos de adenina

                        transporte de Ca++

            rendimiento energético del metabolismo oxidativo

            metabolismo de oxígeno incompletamente reducido: radicales libres

 

Gluconeogénesis

L20-M16

            fuentes: varios aminoácidos, lactato, piruvato, propionato y glicerol

función: cerebro, eritrocito, médula renal, cristalino, córnea, testículos

supervivencia: hipoglucemia y prematurez

ciclos de Cori y alanina

normal: 85-95% por hígado; ayuno o acidosis 50% por riñón; int. delgado <5%

de lactato: lactato deshidrogenasa

            mitosol: piruvato carboxilasa - biotina, Mg2+ y Mn2+

PEP carboxicinasa

            PEP Õ F2,6BP (necesidad de ATP y NADH)

            fructosa 1,6 bisfosfatasa

            glucosa 6-fosfatasa: RE y tres translocasas

de aminoácidos excepto leu y lys

de ácidos grasos de cadena impar: propionato (biotina, B12)

de glicerol: glicerol cinasa y G3P deshidrogenasa

estequiometría

figura : regulación

control hormonal: glucagon, epinefrina y glucocorticoides

hipoglucemia e intoxicación alcohólica

 

Glucógeno

L15y20-M13y16

            hígado contiene hasta 10% del peso húmedo y músculo de 1-2% de su peso

función: en músculo-síntesis de ATP; en hígado para mantener glicemia

gránulos de glucógeno: glucogenina, enzimas de síntesis y degradación, enzimas

reguladoras, glucógeno

figura : estructura

composición: unidades de glucosa en enlaces a1Õ4 y a1Õ6

glucógeno fosforilasa: P de piridoxal y G1P

figura : enzima desramificante: transferasa y glucosa libre

fosfoglucomutasa y G6 fosfatasa

UDP-G pirofosforilasa

glucógeno sintasa

enzima ramificante

figura : cascada de regulación

fosforilasa b – AMP  y glucógeno sintasa D – G6P

figura : enfermedades por almacenamiento de glucógeno

 

Vía de las pentosas

L15-M14

            generación de NADPH y ribosa 5 fosfato

                        biosíntesis reductivas, ác. grasos, colesterol, glutatión, nucleótidos

            fase oxidativa : G6P deshidrogenasa – control por NADPH / NADP+

            lactonasa

                        6 P gluconato deshidrogenasa : NADPH + CO2       

                        P pentosa isomerasa

            fase no oxidativa : interconversiones que lleva a intermediarios glucolíticos

                        P pentosa epimerasa

                        transcetolasa : TPP

                        transaldolasa

            diferentes necesidades de NADPH , R5P y energía de la célula

            deficiencia de G6P deshidrogenasa : anemia hemolítica

                        papel del NADPH – glutatión en el eritrocito

                        ventaja evolutiva

            síndrome de Wernicke-Korsakoff: deficiencia sutil de tiamina

 

Otros polisacáridos

L20-M16

ácido glucurónico: conjugaciones, ictericia fisiológica del recién nacido

biosíntesis de aminoazúcares : transamidaciones

CMP- ácido siálico : gangliósidos, receptores y sitios de reconocimiento celular

lactosa : efecto de la a-lactalbúmina

figura : membranas

glucoproteínas : grupos sanguíneos ABO, moco, hormonas (FS, GC), ceruloplasmina,  plasminógeno, protrombina , inmunoglobulinas

figura  : glicosaminoglucanos - proteoglucanos

hialuronato : líquido sinovial, humor vítreo y cordón umbilical

condroitín : cartílago, tendones, ligamentos, aorta, cerebro, riñón, pulmón

dermatan : piel, vasos sanguíneos y válvulas cardiacas

heparina : intracelular ; heparan : extracelular o en superficie, amiloide

keratan : córnea y cartílago

figura : mucopolisacaridosis

 

 

Segundo parcial

 

 

 

Lípidos

L17-M18

características fisicoquímicas

nomenclatura : numérica, sistemático, trivial, w-n

composición de grasas de la dieta : ácidos grasos esenciales

            tipos y cantidad

            requerimientos: valor calórico

            lípidos esenciales: ácidos linoleico (w-6) y linolénico (w-3)

digestión y absorción

            enzimas digestivas

            sales biliares

emulsificación, circulación entero hepática, esteatorrea

            mal absorción de factores liposolubles

            destino de los lípidos

                        oxidación

                        cuerpos cetónicos

biosíntesis de colesterol y ácidos biliares

                        biosíntesis de lipoproteínas plasmáticas

                        ácidos grasos libres plasmáticos

 

b - Oxidación

            historia

            activación

transporte a la mitocondria : carnitina

            deshidrogenación del enlace carbono-carbono

            hidratación del doble enlace

            oxidación del enlace carbono-oxígeno

            tiolísis : formación de acetil CoA

            estequiometría

            oxidación de ácidos grasos insaturados : isomerasa y reductasa

                        de cadena impar : carboxilasa, epimerasa, mutasa B12 dependiente

            a-oxidación : enf. de Refsum – degradación de clorofila

            w-oxidación : ácidos dicarboxílicos

            cetogénesis : acetoacetato, b-hidroxibutirato y acetona

figura : cetoacidósis diabética y ayuno

 

Síntesis de ácidos grasos

L21-M18y19

            conversión de carbohidratos a grasa es unidireccional

            acetil CoA carboxilasa : síntesis de malonil-CoA

            proteína acarreadora de acilos

            sintasa de los ácidos grasos

            acetil CoA - ACP transacilasa

            b-cetoacil -  ACP sintasa

            malonil CoA – ACP transacilasa

                        b-cetoacil – ACP reductasa

                        b-hidroxiacil – ACP dehidratasa

                        enoil – ACP reductasa

            tioesterasa y la producción de palmitato libre

            comparación a b-oxidación

transporte de unidades acetil y equivalentes reductores

elongación de ácidos grasos

desaturación de ácidos grasos : D4 , D5 , D6 y D9

modificación de ac. grasos poliinsaturados :

ácido araquidónico y docosahexenoico

formación de hidroxiácidos en tejido nervioso

de cadena corta y cadena ramificada

obesidad , leptina

figura : regulación de la síntesis de ácidos grasos

 

Triacilglicéridos y fosfoglicéridos

            biosíntesis de triacilgliceroles

            glicerol3-P, DHAP y diacilglicerol precursores de ácido fosfatídico

            cabezas polares : colina ,etanolamina , serina , inositol , glicerol 3-P

            lecitina , cardiolipina , fosfatidilinositol

                        dipalmitoil lecitina

                        señalización transmembrana , detección inmunológica

            éter fosfolípidos , plasmalógenos , factor activador de plaquetas

            fosfolipasa A1 , A2 , C y D : lisolecitina

 

 

Tercer parcial

 

 

 

Esfingolípidos

            palmitoil-CoA + Ser , NADPH , FADH2 ,à esfingosina à ceramida

            esfingomielina

            glicoesfingolípidos : cerebrósidos , gangliósidos , globósidos , sulfátidos

            figura : enfermedades del catabolismo de esfingolípidos

           

Eicosanoides

            figura : ciclooxigenasa – síntesis de prostaglandinas y tromboxanos

efectos fisiológicos : inflamación . dolor , fiebre  reproducción , secreción de HCl, TA , ducto arterioso , agregación plaquetaria

            vía de lipooxigenasa : leucotrienos e hidroxieicosatetraenoicos (HETE)

                        regulan función celular inmunológica , constricción músculo liso , alergia

agentes antiinflamatorios esteroideos , no esteroideos y aspirina

anandamida

 

Colesterol

isoprenos : esteroides , ubiquinona , retinol , a-tocoferol , hule , limoneno , etc.

estructura e historia

síntesis de mevalonato : 3-HMG CoA  reductasa

síntesis de escualeno : isopentenil pirofosfato

ciclización y conversión a colesterol

control de la síntesis de colesterol

sales biliares y diagrama de fases

hormonas est. : progesterona , cortisol , aldosterona , andrógenos , estrógenos

colecalciferol   : UV , raquitismo , osteomalacia , paratohormona y 1,25(OH)D3

 

Lipoproteínas

            figura : composición de las lipoproteínas

figura : transporte

figura : metabolismo

 

 

Cuarto parcial

 

 

 

Examen FINAL

 

 

 

BIBLIOGRAFIA:

 

o        Lehninger, Principles of Biochemistry, Third Edition ­

David L. Nelson and Michael M. Cox

WORTH PUBLISHERS ©2000

Capítulos 1 y del 14 al 21

 

o        Mathews · van Holde, Bioquímica, Segunda Edición  (está la tercera en inglés)

MCGRAW-HILL · INTERAMERICANA ©1996

Capítulos 1 y del 12 al 19

 

o        Thomas M. Devlin, Textbook of BIOCHEMISTRY with clinical correlations,

Fourth Edition. WILEY– LISS, INC ©1997

Capítulos del 6 al 10

 

o        Otros textos con sus capítulos equivalentes (Voet, Stryer, Montgomery, etc.)

 

o        Lehninger 3rd Edition (http://www.worthpublishers.com/lehninger/)

 

o        Mathews/van Holde/ 3rd Edition (http://www.aw.com/mathews/)

 

o        Metabolic Pathways of Biochemistry (http://www.gwu.edu/~mpb)

 

o        Modelos moleculares http://info.bio.cmu.edu/Courses/BiochemMols/

 

o        Una Buena página de Bioquímica http://web.indstate.edu/thcme/mwking/home.html

 

Biochemistry  Stryer 5th Edition http://www.whfreeman.com/biochem5

 

Molecular Cell Biology 4.0 Lodish http://www.whfreeman.com/lodish