中藥的品種繁多，同名異物或是藥物不同，但是形態相近的情形不少，以致有些有毒草藥被當成無毒的草藥誤用，這種誤食中毒情形不少；另外，對中藥毒性認識不足，輕易嘗食才會引發中毒意外。

用藥過量，是中草藥導致腎損害的重要原因。

以中藥木通為例，根據《藥典》記載，用量是六至九克，益母草的用量是十五至三十克，但是，臨床上服用木通和益母草造成腎功能損害、腎功能衰竭，用量多在六十克至一百二十克，並且反覆使用多次，也有的是因為中藥本身就是毒物，因而容易發生過量中毒，諸如使用雷公藤不當引起中毒的個案 。

有些中藥單次使用劑量不大，但是連續服用也會導致蓄積中毒，造成腎損害。長期使用含有防己、厚朴的減肥中藥，會引起慢性間質性腎炎，另外含金屬、礦石成分的中藥，通常在體內代謝極慢，因此不但單次用量要嚴格控制，長期服用更易造成腎損害，都得由醫師仔細拿捏。

中藥炮製和儲存過程，也很重要，若已變質，服用也有中毒的可能。 諸如草烏、巴豆都是毒性較強的生藥，若是炮製不當或是未經炮製，儘管服用劑量正常，也會嚴重中毒。另外，中藥材若在儲存過程中保存不當，導致發黴或變質，就算經處理後才服用，還是會造成腎損害。

中藥飲片得煎服, 不同藥，煮法也不同，煮的時間、方式不正確，也會造成腎損害。  像雷公藤根芯木質部分，第一煎需要煎二小時飲用，第二煎要煎一小時以上服用，若是煎煮時間不夠長，服用後極易中毒。而山豆根正好相反，煎煮時間愈長，毒性副作用愈強。除此之外，藥器也很重要，用錯也會造成中毒，金屬鍋煎藥就會導致某些藥物藥性變化引起中毒。

另外，過敏體質也是造成腎損害的原因之一， 每個人對藥物反應都不同，可以反映在質和量方面，某些藥物超劑量使用對一般人不出現毒性，但是過敏體質就可能引起中毒，體虛弱的人對藥物耐受力差，服用正常劑量也有中毒的顧慮，所以患者服用中藥還應由醫師處方，切勿自行購服。